Исследователи из МГУ, Центра Гамалеи и ФМБА разработали программу scParadise, которая автоматически определяет типы клеток и предсказывает их свойства на основе генетических данных. Инструмент способен отличать раковые клетки от здоровых, а также выявлять иммунные клетки, вызывающие
хроническое воспаление при ожирении. Это поможет исследователям понять механизмы развития заболеваний и создавать более эффективные персонализированные лекарства. В основе scParadise — уникальные архитектуры нейросетей, обученные на данных секвенирования одиночных клеток. В экспериментах разработка показала точность 99,9%. Коллективу уже удалось доказать наличие в жировой ткани трёх
новых подтипов иммунных клеток, существование которых предсказала модель. Программа доступна для бесплатного скачивания и использования специалистами по всему миру. Отмечается, что авторы постоянно обучают и выкладывают в открытый доступ новые модели для разных клеток, тканей и даже организмов — не только людей, но и
животных. «Нейросети обучены на данных секвенирования одиночных клеток. Нередко мы собирали данные по одной ткани, сделанные сразу в нескольких лабораториях. Все эти данные мы обрабатывали и сводили в единый массив, приемлемый для обучения нейросети», — пояснила один из авторов работы, младший научный сотрудник Научно-исследовательской лаборатории генных и клеточных технологий Медицинского
научно-образовательного института МГУ имени М.В. Ломоносова Елизавета Чечехина.